百圖生科AIGP平臺發(fā)布：提供多種蛋白質生成能力，加速前沿生命科學研究

來源：華爾街見聞 ? 2023-03-23 20:04:40

近日來，ChatGPT和文心一言等超大規(guī)模預訓練模型紛紛登場，讓我們看到了AI破解人類自然語言的力量。

(資料圖)

成立兩年多來，BioMap百圖生科一直致力于打造生命科學領域的AI大模型，構建了千億參數(shù)的跨模態(tài)大模型?“xTrimo” （The Cross-Modal Transformer Representation of Interactome and Multi-Omics）。該大模型從跨物種、跨模態(tài)的生命信息中學習蛋白質如何構成和實現(xiàn)功能、如何相互作用、如何組合和調(diào)控細胞功能的關鍵規(guī)律，從而破解生命的自然語言——蛋白質?；诖竽Ｐ停珹I在一系列任務算法上取得了明顯的進展，除了更好地完成結構預測等基礎任務外，也開始可以根據(jù)不同的問題輸入，以生成的方式，設計創(chuàng)新的蛋白質，來回答各種生命科學問題。

2023 年 3 月 23 日，百圖生科在北京發(fā)布生命科學大模型驅動的?AIGP——AI Generated Protein?平臺，旨在將這一技術平臺的能力與更多行業(yè)伙伴分享，利用設計創(chuàng)新蛋白質的能力，共同研發(fā)更多的前沿藥物和其他生命科學項目，也通過挑戰(zhàn)性的新任務，驅動AIGP平臺的技術進步。

在發(fā)布前，AIGP平臺已經(jīng)進行了一段時間的內(nèi)部測試，在百圖生科內(nèi)部承載了其創(chuàng)新免疫調(diào)控藥物 ImmuBot 的研發(fā)工作，貢獻了多個高性能彈頭、新功能傳感器的研發(fā)案例。

除此之外，有近20家合作伙伴和百圖生科開展了AIGP聯(lián)合研發(fā)合作，方向覆蓋高性能彈頭設計、新功能蛋白質設計、靶點挖掘和調(diào)控蛋白設計等領域，其中多個項目取得了階段性的發(fā)現(xiàn)成果。在合作的創(chuàng)新藥企、學術PI的幫助下，AIGP平臺也進行了諸多優(yōu)化。

因此，本次百圖生科AIGP平臺的對外發(fā)布，意味著對平臺創(chuàng)新蛋白質的生成能力開啟“公測”新階段，也意味著百圖生科AIGP平臺將為更多伙伴，亦面向包括科研、環(huán)保、材料、消費等更多場景的需求，提供解決方案。

圖: AIGP3大功能模塊+12項核心能力示意圖

目前，百圖生科AIGP平臺設置了3類功能模塊，分別是Function to Protein Design（F2P，根據(jù)結構、功能、可開發(fā)性等功能指標設計/優(yōu)化蛋白質）、Protein to Protein Design（P2P，給定抗原等目標蛋白，設計與之以特定方式結合的抗體等蛋白）、以及Cell to Protein Design（C2P，給定細胞，發(fā)現(xiàn)調(diào)控細胞功能的靶點蛋白并設計相應的調(diào)控蛋白）。

根據(jù)不同模塊的輸入和要求，AIGP平臺可在較短時間內(nèi)設計和生成具有特定性質的蛋白質。

隨著面向合作伙伴的公測階段取得進展，百圖生科計劃于2023年6月起將部分功能模塊進一步開放，讓專業(yè)用戶可以直接自主使用，在更多的研究場景調(diào)用AI的蛋白質生成能力，激發(fā)更多的生命科學探索。

對于百圖生科AIGP平臺的發(fā)布，世界生物信息學界的著名學者、哈佛計算生物醫(yī)學中心創(chuàng)始主任、R語言的主要發(fā)明人、百圖生科科學顧問委員會委員Robert Gentleman教授表示，在哈佛，他的團隊同樣在進行蛋白質生成/預測模型的相關研究，“百圖生科在這個方向上走得很遠了”。

他期待，AIGP會帶來更多的蛋白質/抗體生成模型，抗體工程師們可能會從這些模型的預測中，發(fā)現(xiàn)自己從未注意過的細節(jié)，“如果將這些模型視作‘idea generator’，一切會變得更加美妙”。

中國科學院院士、著名免疫學家董晨教授認為：“AI能夠解決的問題，就是對大數(shù)據(jù)的分析和進一步的演繹和應用。在當下的時間節(jié)點，AIGP確實是一個呼之欲出的平臺。相信AIGP對于我們理解蛋白質，以及在生物系統(tǒng)中研究和發(fā)現(xiàn)它的功能和調(diào)控，乃至于將來研發(fā)新藥，都會有非常大的作用?！?/p>

圖 : 百圖生科CTO 、首席AI科學家宋樂博士

從AIGC到AIGP，人工智能的生成和預測能力對真實世界的影響將進一步加深。

而AIGP能力的背后，正是百圖生科在底層技術上的持續(xù)投入，以及與合作伙伴對前沿創(chuàng)新的共同追求。發(fā)布會上，百圖生科CTO宋樂博士對此進行了詳細介紹。

此前的媒體采訪中，宋樂博士也表示：“因為生命體的高度復雜度。目前數(shù)據(jù)量很大，但仍然是有限的。隨著生命科學領域觀測手段和技術的發(fā)展，將使我們能夠更加精細精準地理解進化，理解生命。這也就意味著，要實現(xiàn)這一目標，我們需要不斷吸納新的合作伙伴?！?/p>

正如百圖生科CEO劉維在本次發(fā)布活動所提到的，雖然百圖生科的AI大模型和與之配套的大規(guī)模數(shù)據(jù)圖譜、高通量驗證體系都遠不完美，但已經(jīng)凝結了很多前沿技術的創(chuàng)新和探索，接下來，從開始展露一些能力到提高它的泛化能力和速度，需要專業(yè)伙伴的合作的加入，而且，合作伙伴也將得益這一系列嘗試，實現(xiàn)前沿項目的加速研發(fā)。

本文作者：AIGP，來源：BioMap百圖生科，原文標題：《百圖生科AIGP平臺發(fā)布：提供多種蛋白質生成能力，加速前沿生命科學研究》

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